まず<a>タグで、link, visited, hover, activeともオレンジ色に設定しています。その後、class名がnavの場合には、link, visitedだけネイビーに設定しています。aよりも.nav aの方が優先順位が高く上書きされるということですが、そうするとhoverやactiveの場合は上書きがされずにオレンジ色が残るのではないでしょうか。
しかし、実際にはナビゲーションの部分にカーソルを乗せた場合やクリックした場合、オレンジ色にはならずネイビーです。となると、「色の設定をしない」ということを上書きしているのでしょうか。そのように考えると納得はいくのですが、また別の疑問が浮かびます。
.nav aではlinkとvisitedに色の指定をして、hoverとactiveには色の設定をしないという設定をしたことになると思うのですが、その場合にホバーさせた場合、link(or visited)かつhoverになるのでlink(or visited)にhoverが上書きされて、色の設定はしない=デフォルトの色になる、となるのではないかと思えます。しかし現実はlink(or visited)で設定した色になります。
わかりづらい文章になってしまっているかと思いますが、どうか回答をお願いいたします。